當時擔任台北市長的馬英九，嚴詞抨擊陳水扁軟弱，為什麼不敢大聲說釣魚台是中華民國的領土。馬英九甚至呼籲，政府必須要有不惜一戰的態度，才能讓日方重回談判桌。 三年後，台日在釣魚台海域爆發更嚴重的衝突，這一次我國漁船是直接被日艦撞沉，對我主權的侵犯和挑釁。 但馬英久政府的處理態度呢？外交部在案發後四十小時才發出官腔官調的新聞稿，軟弱的重申擁有釣魚台主權。行政院則像自我安慰式的希望日方能儘快重啟漁權談判。但事實上是，日本媒體報導我海巡署在前往接人時，被認為是「入侵」日本領海，外交部卻默不作聲，置若罔聞。